Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap25P60879 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap25P60879 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap25P60879 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap25P60879 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms