Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rims4P60191 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rims4P60191 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms