Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CgnP59242 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CgnP59242 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CgnP59242 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CgnP59242 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CgnP59242 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CgnP59242 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CgnP59242 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CgnP59242 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CgnP59242 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CgnP59242 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CgnP59242 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CgnP59242 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CgnP59242 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CgnP59242 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CgnP59242 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CgnP59242 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CgnP59242 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CgnP59242 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CgnP59242 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CgnP59242 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CgnP59242 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CgnP59242 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CgnP59242 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CgnP59242 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CgnP59242 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CgnP59242 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CgnP59242 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CgnP59242 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CgnP59242 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CgnP59242 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CgnP59242 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CgnP59242 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CgnP59242 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CgnP59242 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CgnP59242 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CgnP59242 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CgnP59242 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CgnP59242 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CgnP59242 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CgnP59242 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CgnP59242 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CgnP59242 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CgnP59242 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CgnP59242 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CgnP59242 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CgnP59242 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CgnP59242 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CgnP59242 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CgnP59242 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CgnP59242 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CgnP59242 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CgnP59242 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CgnP59242 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CgnP59242 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CgnP59242 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CgnP59242 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CgnP59242 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CgnP59242 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CgnP59242 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CgnP59242 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CgnP59242 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CgnP59242 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CgnP59242 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CgnP59242 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CgnP59242 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CgnP59242 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CgnP59242 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CgnP59242 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms