Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup43P59235 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup43P59235 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup43P59235 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup43P59235 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms