Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scarf2P59222 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms