Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps33bP59016 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps33bP59016 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms