Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhbdl3P58873 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms