Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn4P58404 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn4P58404 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn4P58404 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms