Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opa1P58281 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Opa1P58281 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opa1P58281 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms