Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dpf3P58269 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dpf3P58269 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dpf3P58269 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms