Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf2P58021 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tm9sf2P58021 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms