Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Snrpa1P57784 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Snrpa1P57784 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms