Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtnsP57757 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtnsP57757 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtnsP57757 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtnsP57757 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtnsP57757 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtnsP57757 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtnsP57757 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CtnsP57757 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtnsP57757 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtnsP57757 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtnsP57757 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtnsP57757 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms