Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Samsn1P57725 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Samsn1P57725 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samsn1P57725 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samsn1P57725 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samsn1P57725 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms