Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NcstnP57716 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NcstnP57716 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NcstnP57716 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NcstnP57716 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NcstnP57716 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms