Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace1P56818 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace1P56818 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace1P56818 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace1P56818 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace1P56818 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Bace1P56818 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms