Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp2c40P56657 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c40P56657 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms