Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp5P56399 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp5P56399 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp5P56399 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp5P56399 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp5P56399 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms