Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GferP56213 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GferP56213 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GferP56213 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GferP56213 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GferP56213 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GferP56213 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GferP56213 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GferP56213 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GferP56213 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GferP56213 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GferP56213 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GferP56213 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GferP56213 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GferP56213 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms