Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp1P56183 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rrp1P56183 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms