Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GemP55041 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GemP55041 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GemP55041 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GemP55041 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GemP55041 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GemP55041 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GemP55041 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GemP55041 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GemP55041 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GemP55041 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GemP55041 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GemP55041 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GemP55041 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GemP55041 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GemP55041 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GemP55041 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GemP55041 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GemP55041 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms