Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Faf1P54731 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms