Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PitpnbP53811 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms