Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx4P53776 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx4P53776 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms