Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtbP53612 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtbP53612 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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