Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ApodP51910 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ApodP51910 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ApodP51910 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ApodP51910 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ApodP51910 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ApodP51910 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ApodP51910 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ApodP51910 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ApodP51910 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApodP51910 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApodP51910 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApodP51910 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApodP51910 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApodP51910 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms