Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CntfP51642 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CntfP51642 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CntfP51642 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CntfP51642 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CntfP51642 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CntfP51642 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CntfP51642 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CntfP51642 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CntfP51642 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CntfP51642 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CntfP51642 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfP51642 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfP51642 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CntfP51642 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms