Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpcP51612 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpcP51612 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XpcP51612 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XpcP51612 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XpcP51612 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XpcP51612 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XpcP51612 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XpcP51612 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XpcP51612 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XpcP51612 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XpcP51612 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XpcP51612 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XpcP51612 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XpcP51612 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XpcP51612 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpcP51612 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpcP51612 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpcP51612 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpcP51612 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpcP51612 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpcP51612 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpcP51612 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XpcP51612 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XpcP51612 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XpcP51612 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XpcP51612 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XpcP51612 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpcP51612 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpcP51612 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpcP51612 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpcP51612 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpcP51612 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpcP51612 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpcP51612 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpcP51612 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XpcP51612 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XpcP51612 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XpcP51612 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms