Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TspoP50637 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TspoP50637 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TspoP50637 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TspoP50637 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TspoP50637 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TspoP50637 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TspoP50637 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TspoP50637 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TspoP50637 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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TspoP50637 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TspoP50637 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TspoP50637 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TspoP50637 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TspoP50637 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TspoP50637 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TspoP50637 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TspoP50637 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TspoP50637 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TspoP50637 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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