Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdk5P49615 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk5P49615 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk5P49615 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms