Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrna7P49582 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrna7P49582 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms