Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx1P48377 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx1P48377 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms