Protein–RNA interactions for Protein: P48318

Gad1, Glutamate decarboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gad1P48318 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gad1P48318 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gad1P48318 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms