Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx2P48031 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms