Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax9P47242 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax9P47242 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms