Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf4P43488 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms