Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx1-2P42580 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx1-2P42580 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms