Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept1P42209 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept1P42209 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept1P42209 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept1P42209 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept1P42209 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept1P42209 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sept1P42209 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept1P42209 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept1P42209 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms