Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rpl28P41105 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rpl28P41105 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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