Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VhlP40338 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VhlP40338 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VhlP40338 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VhlP40338 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VhlP40338 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VhlP40338 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VhlP40338 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms