Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csf3rP40223 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms