Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd1P40201 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd1P40201 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd1P40201 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chd1P40201 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd1P40201 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chd1P40201 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Chd1P40201 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Chd1P40201 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms