Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ly6fP35460 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ly6fP35460 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6fP35460 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms