Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ly6dP35459 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ly6dP35459 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly6dP35459 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms