Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin1P35438 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grin1P35438 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Grin1P35438 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms