Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TpoP35419 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TpoP35419 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TpoP35419 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TpoP35419 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TpoP35419 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TpoP35419 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TpoP35419 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TpoP35419 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TpoP35419 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TpoP35419 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TpoP35419 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TpoP35419 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TpoP35419 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TpoP35419 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TpoP35419 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TpoP35419 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TpoP35419 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TpoP35419 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms