Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3dP35276 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms