Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stfa1P35175 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stfa1P35175 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms