Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa3P35173 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa3P35173 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa3P35173 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa3P35173 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa3P35173 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa3P35173 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa3P35173 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa3P35173 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stfa3P35173 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stfa3P35173 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stfa3P35173 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms