Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp4P35123 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp4P35123 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp4P35123 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp4P35123 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp4P35123 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp4P35123 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms